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蘇木素是從洋蘇木中提取的一種染色劑，它在被氧化后生成蘇木精，同媒染劑（常用的是三價的鐵或鋁的鹽）一起使用，能夠使細胞核染色。蘇木素是一種堿性染料。

 蘇木素和伊紅在組織學上被經常使用，與碘液不同，這是一種*染色劑。其他常用的含有蘇木素的染色劑有磷鎢酸蘇木素染色劑，也就是磷鎢酸與蘇木素的混合物。

化學結構簡式蘇木素染色劑經常為組織的研究使用。 明礬和三價鐵鹽常常被用作媒染劑，展示核和細胞質結構。這些媒染劑的原理都是形成媒染劑－染料－組織復合體，從而顯示顏色。使用的鹽不同顏色也不同： 當用鐵鹽呈現深藍色顏色沉淀，用鋁鹽通常顯示藍白色。下面分別介紹鋁蘇木素溶液和鐵蘇木素溶液。 

在20世紀70年代，由于巴西熱帶雨林被大量砍伐，洋蘇木大量減少，蘇木素的產量隨即大量減少。蘇木素的價格上升驚人，因而大大提高了組織病理學診斷的成本，引起了尋找蘇木素替代品的高潮。不過，在各種蘇木素的替代品的地位真正確立之前，蘇木素又重返市場，又在組織病理學診斷中發揮其重要作用。到2013年為止，幾種推薦使用的替代染劑有鉻天青、焙花青、茜素紫（又名焦沒食子酚酞、棓因)。這些染料都用三價鐵離子作為媒染劑。焙花青還可以用鉻礬作媒染劑。